NEBNext Direct ist eine neue, innovative Technik zur hochspezifischen Zielsequenz-Anreicherung interessierender genomischer DNA inkl. Library Prep für Illumina-basiertes NGS. NEBNext Direct bietet Ihnen dabei die Präzision und Geschwindigkeit ähnlich Multiplex-PCR-basierter Ansätze und die Einfachheit und Skalierbarkeit hybridisierungbasierter Methoden.
Dieser neue, einzigartige Prozess (siehe Schemazeichnung unten) erlaubt daher die schnelle und trotzdem zuverlässige Analyse von Einzelgenen bis hin zu umfassenden Datensätzen mit mehreren hundert Genen – von der Probe bis zur Sequenzanalyse in nur einem Tag!
Unabhängig vom Ihrer Test-DNA oder Assay-Ausrichtung, NEBNext Direct ermöglicht Ihnen die Analyse der interessierenden Zielsequenzen „target with precision“.
Workflow
Ihre Vorteile
- Einzigartige Hybridisierungstechnologie kombiniert mit Library Prep für hochspezifische und gleichmäßige Anreicherung der gewünschten Zielsequenzen:
- Hohe „on-target“-Rate unabhängig vom
AT-/GC-Gehalt - Gleichmäßige Repräsentation der
Target-Regionen - „Übersequenzierung“ für seltene
Fragmente unnötig - Geringere nachfolgende Sequenzierkosten
- Hohe „on-target“-Rate unabhängig vom
- Zeitersparnis durch einen schnellen Workflow:
Vom Sample zur Library in nur einem Tag. - Generiert hochwertige Libraries auch bei limitierter Input-Menge oder degradierter DNA (z.B. FFPE und ctDNA)
- Unterscheidung molekularer Duplikate durch Unique Molecular Index (UMI) Strategie: Einfache und zuverlässige Detektion von falsch-positiven Varianten und erhöhter Sensitivität
- Hybridisieren der Sonden durch Zugabe der Puffer bei Raumtemperaturen bei hoher „on-target“-Rate –
kein lästiges Erhitzen mehr notwendig. - On-Bead-Prozess – ideal für automatisierte Laborabläufe.
Kundenstimmen
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„Using the NEBNext Direct kit, we were able to detect all known single nucleotide variants and indels in DNA extracted from fresh frozen or FFPE tissue derived from glioma biopsies. We could also clearly see amplification in genes like EGFR or PDGFR. The workflow is really easy and fast and can be rapidly implemented in a lab.“ Yannick Marie, Sequencing Core Facility Manager, Brain and Spine Institute (ICM) |
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„The kit and its technology are easy to use and easy to automate, allowing us to get up and running quickly. The protocol itself is fast and efficient to obtain deep coverage of targets, giving homogeneous results for FFPE and frozen tumors, therefore opening doors for customized panels.“ Francis Rousseau, Ph.D., Director of Genomics for IntegraGen SA |
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Lesen Sie auch den FEATURE ARTICLE zum Thema:
„Overcoming the challenges of applying target enrichment for translational research“
von Andrew Barry, MS, Produktexperte bei NEB Inc.
Videos
Verfügbare Produkte:
NEBNext Direct® Custom Ready Panels
Wählen Sie die für Ihre Arbeit relevanten Gene aus einer stets wachsenden Liste. Wir haben für diese Gene bereits die entsprechenden Sonden für die vollständige kodierende Region vorgefertigt, funktionsoptimert und -geprüft vorliegen. So können wir besonders schnell Ihr maßgeschneidertes und werkseitig getestetes Panel ausliefern.
In einem praktischen Online-Prozess stellen Sie sich Ihr gewünschtes Gen-Panel aus hunderten von alphabetisch sortierten Genen in der von Ihnen gewünschten Kombination zusammen.
- Profitieren Sie von der NEBNext Direct Technologie durch unerreichte Spezifität und Uniformität der Abdeckung
- Genießen Sie schnellste Protokolle: Erhalten Sie Ihre Sequenzierdaten in nur einem Arbeitstag in einem automationsfreundlichen Prozess
- Nutzen Sie die erhöhte Spezifität dank Unique Molecular Identifiers (UMI)
- Stellen Sie sich Ihr NGS Target Enrichment Panel selbst online zusammen
- Wählen Sie Einzelgene oder beliebige Kombinationen aus einer Liste von hunderten von Genen
- Erfahren Sie schnellste Lieferzeiten unabhängig von der Projektgröße
NEBNext Direct® Cancer HotSpot Panel
Das NEBNext Direct Cancer HotSport Panel umfasst Sonden für beide Stränge von 190 Krebs-relevanten Genombereichen in insgesamt 50 Genen, was einer Sequenz von ca. 40 kb und 18.000 COSMIC Features entspricht.
Das Panel wurde optimiert für zur Herstellung von entsprechenden 150 bp langen, Target-angereichten Libraries für die Illumina-Plattformen.
NEBNext Direct® BRCA1/BRCA2 Panel
Mit dem neuen NEBNext Direct® BRCA1/BRCA2 Panel reichern Sie die vollständigen Exone von BRCA1 und BRCA2 an. Unser schneller und einzigartiger NEBNext Direct Workflow ermöglicht Ihnen dabei die direkte Hybridisierung von Bead-gebundenen, hoch-spezifischen Ködersequenzen an die zu untersuchende gDNA ohne vorherige Herstellung einer NGS-Library.
Das Resultat:
Eine extrem hohe Sequenzgenauigkeit und -abdeckung bei einer exzellenten, gleichförmigen Verteilung in einem schnellen 1-Tag Protokoll
- Vollständige Abdeckung (100%) aller codierender Regionen der Gene BRCA1 und BRCA2
- Einheitliche Sequenziertiefe über alle Targets - 100% der Basenpaare im Panel haben eine Abdeckung von mehr als 20% der mittleren Target Abdeckung
- Kompaktes eintägiges Protokoll, in dem die hochspezifische Anreicherung direkt mit der Library Prep kombiniert wird.
- Geeignet zur Detektion von Keimbahn- und somatischen Variationen aufgrund extrem hoher Target Abdeckung bei verschiedenen Inputmengen.
Das NEBNext Direct BRCA1/BRCA2 Panel liefert eine effiziente Anreicherung der BRCA1 und BRCA2 codierenden Regionen mit einem hohen Prozentsatz von On-Target Reads.
Produkttabelle
| PRODUKT | Art. # | GRÖSSE | PREIS | ||
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| NEU: NEBNext Direct® Custom Ready Panels | E6631S | 8 rxns | auf Anfrage; abhängig von Panelinhalt |  |
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| E6631L | 24 rxns | ||||
| E6631X | 96 rxns | ||||
| NEBNext Direct® Cancer HotSpot Panel | E7000S | 8 rxns | 1.160 € |  |
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| E7000L | 24 rxns | 3.400 € | |
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| E7000X | 96 rxns | 10.280 € | |
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| NEBNext Direct® BRCA1/BRCA2 Panel | E6627S | 8 rxns | 660 € | |
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| E6627L | 24 rxns | 1.900 € | |
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| E6627X | 96 rxns | 6.950 € | |
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Stand: 01.01.2020
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innovativen Ansatz für Target Enrichment für Next Gen Sequencing.
Weiterführende Informationen finden Sie unter Technische Ressourcen oder auf neb.com. Informationen zu Namensrechten finden Sie hier.
