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Restriktionsenzyme für epigenetische Analysen

Viele Restriktionsenzyme werden durch DNA Methylierung beeinflusst.
Wenn bestimmte Basen in der Erkennungssequenz modifiziert sind kann die Spaltung der DNA behindert oder vollständig blockiert werden. Die Wissenschaftler von New England Biolabs haben vor einiger Zeit die MspJI Familie der Restriktionsenzyme entdeckt, welche in Abhängig von DNA Methylierung bzw. Hydroxymethylierung DNA schneiden.

Die Enzyme der MspJI Familie schneiden ein 32 bp Fragment um eine zentrale 5-hmC oder 5-mC Base aus. Diese Fragmente können anschließend sequenziert werden, was eine Lokalisierung der Methylierung ohne Bisulfit-Konvertierung möglich macht.

Diese EpiMark validierten Enzyme schaffen neue Möglichkeiten bei der Untersuchung von DNA Methylierungen und insbesondere beim Verständnis der Rolle von 5-Hydroxymethyl-Cytosin.

Auch andere methylierungsabhängige Restriktionsenzyme können für epigenetische Studien eingesetzt werden, wie beispielsweise DpnI und DpnII, welche die gleiche DNA Sequenz abhängig vom Methylierungsstatus erkennen.

Ihre Vorteile:
  • Spezifische Enzyme zur Erkennung von epigenetisch relevanten DNA Modifikationen (5-mC and 5-hmC)
  • Einfache Protokolle (Enzymverdau und anschließende Gel-Extraktion)
  • Weniger harsch im Vergleich zu Bisulfit-Konvertierung
  • Einfache Analyse der Ergebnisse
Methylation sensitive enzymes Gel

MspJI vereinfacht die Analyse von DNA Methylierungsmustern
MspJI erkennt methylierte und hydroxymethylierte DNA und schneidet ein 32 bp Fragment aus, welches anschließend sequenziert werden kann.
Das Bild zeigt Übernacht-Verdaus von je 1 µg genomischer DNA verschiedenen Ursprungs (DNA aus Hefe weißt keine Methylierung auf).

Produkttabelle

PRODUKT Art. # GRÖSSE PREIS
MspJI, recombinant R0661S 200 units 108 € In den Shop wechseln Produktinformationen
R0661L 1.000 units 432 € In den Shop wechseln Produktinformationen
FspEI, recombinant R0662S 200 units 106 € In den Shop wechseln Produktinformationen
LpnPI, recombinant R0663S 200 units 108 € In den Shop wechseln Produktinformationen
DpnI, recombinant R0176S 1.000 units 65 € In den Shop wechseln Produktinformationen
R0176L 5.000 units 260 € In den Shop wechseln Produktinformationen
DpnII, recombinant R0543S 1.000 units 72 € In den Shop wechseln Produktinformationen
R0543L 5.000 units 288 € In den Shop wechseln Produktinformationen
DpnII, recombinant, conc. R0543T 1.000 units 72 € In den Shop wechseln Produktinformationen
R0543M 5.000 units 288 € In den Shop wechseln Produktinformationen
McrBC M0272S 500 units 70 € In den Shop wechseln Produktinformationen
M0272L 2.500 units 280 € In den Shop wechseln Produktinformationen
MspI, recombinant R0106S 5.000 units 64 € In den Shop wechseln Produktinformationen
R0106L 25.000 units 256 € In den Shop wechseln Produktinformationen
MspI, recombinant, conc. R0106T 5.000 units 64 € In den Shop wechseln Produktinformationen
R0106M 25.000 units 256 € In den Shop wechseln Produktinformationen
HpaII, recombinant R0171S 2.000 units 65 € In den Shop wechseln Produktinformationen
R0171L 10.000 units 260 € In den Shop wechseln Produktinformationen
HpaII, recombinant, conc. R0171M 10.000 units 260 € In den Shop wechseln Produktinformationen

Stand: 03.01.2019

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