Das Archivieren von klinischen Zell- oder Gewebeproben als Formalin-fixiertes, in Paraffineingebettetes Material (FFPE) ist eine gängige Methode, da die Zellmorphologie und der Gewebekontext nahezu erhalten bleiben. Für DNA hingegen ist diese Prozedur und Lagerung problematisch, da durch FFPE-Archivierung signifikante DNA-Schäden entstehen. Durch Thymin-Desaminierung entsteht Uracil, Oxidation schädigt die Basen, 3′ Enden können blockiert sein und Nicks und Gaps verhindern eine gute Amplifikation.
Neue Formulierung – jetzt noch besser!
Der NEBNext FFPE DNA Repair v2 Module ist ein Cocktail aus spezifischen DNA-Repair-Enzymen und optimiert für den Einsatz bei nachfolgender NGS-Library Konstruktion. Der Mix erhöht typischerweise die Ausbeuten und Erfolgsraten zwischen zwei- und vierfach (in Abhängigkeit vom Material) und führt dabei zu keiner Sequenz-Verfälschung verglichen mit dem Ausgangsmaterial!
- Zuverlässiges und einfaches Protokoll
- Verbessert die Library-Qualität durch Reparatur von Schäden aus FFPE-Lagerung
- Keine Veränderung/Bias im Vergleich zu unbehandelter Sequenz
Testen Sie das NEBNext FFPE DNA Repair v2 Module kostenfrei:
Abb: So einfach lässt sich das NEBNext FFPE DNA Repair v2 Module in den Library Prep Workflow integrieren
Abb: Erhöhte Library-Ausbeuten nach Behandlung der DNA-Probe mit dem NEBNext FFPE DNA Repair v2 Module
Weiterführende Informationen finden Sie unter Technische Ressourcen oder auf neb.com. Informationen zu Namensrechten finden Sie hier.