FFPE DNA Repair Mix

NEBNext FFPE DNA Repair Mix

Das Archivieren von klinischen Zell- oder Gewebeproben als Formalin-fixiertes, in Paraffineingebettetes Material (FFPE) ist eine gängige Methode, da die Zellmorphologie und der Gewebekontext nahezu erhalten bleiben. Für DNA hingegen ist diese Prozedur und Lagerung problematisch, da durch FFPE-Archivierung signifikante DNA-Schäden entstehen. Durch Thymin-Desaminierung entsteht Uracil, Oxidation schädigt die Basen, 3′ Enden können blockiert sein und Nicks und Gaps verhindern eine gute Amplifikation.

Der NEBNext FFPE DNA Repair Mix ist ein Cocktail aus spezifischen DNA-Repair-Enzymen und optimiert für den Einsatz bei nachfolgender NGS-Library Konstruktion. Der Mix erhöht typischerweise die Ausbeuten und Erfolgsraten zwischen zwei- und vierfach (in Abhängigkeit vom Material) und führt dabei zu keiner Sequenz-Verfälschung verglichen mit dem Ausgangsmaterial!

Ihre Vorteile:
  • Zuverlässiges und einfaches Protokoll
  • Verbessert die Library-Qualität durch Reparatur von Schäden aus FFPE-Lagerung
  • Keine Veränderung/Bias im Vergleich zu unbehandelter Sequenz
  • Anwendung direkt vor dem Library Prep Schritt, daher kompatibel mit allen Sequenzierplattformen und Workflows

Abb: Unverfälschte Ergebnisse mit (+) oder ohne (-) NEBNextFFPE DNA Repair Mix Behandlung

FFPE Mapped Reads

Abb: Erhöhte Library-Ausbeuten nach Behandlung der DNA-Probe mit dem NEBNext FFPE DNA Repair Mix an Magenkrebs FFPE-Proben. Blau: unbehandelt, rot: behandelt

FFPE DNA Repair Mix

Produkttabelle

PRODUKT Art. # GRÖSSE PREIS
NEBNext® FFPE DNA Repair Mix M6630S 24 rxns 173 € In den Shop wechseln Produktinformationen
M6630L 96 rxns 604 € In den Shop wechseln Produktinformationen

Stand: 03.01.2019

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